Computational / Data Scientist – GIMM Computational / Data Scientist – GIMM

Open Call for Computational / Data Scientist

Open Call for Computational / Data Scientist

O GIMM – Gulbenkian Institute for Molecular Medicine é uma fundação privada de investigação portuguesa pioneira, com uma visão ambiciosa da exploração científica fundamental e do seu profundo impacto na saúde e bem-estar globais. Fundado em 2023, o GIMM é o resultado da fusão de dois institutos de investigação de referência: Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes (iMM) e Instituto Gulbenkian de Ciência (IGC), que se dedica a desvendar os mistérios fundamentais da vida e tem como objetivo estar na vanguarda da investigação transdisciplinar.

O GIMM abre concurso de seleção para a contratação de um(a) investigador(a) doutorado(a) (Computational / Data Scientist), correspondente ao nível inicial nos termos da legislação aplicável, em regime de contrato de trabalho a termo incerto, no âmbito do projeto “IMM-Care- Boosting Clinical Research for the Benefit of Society”HORIZON-WIDERA-2022- ACCESS-01-01-two-stage,financiado pela Comissão Europeia e com co-financiamento do Governo Português. O(A) Investigador(a) irá juntar-se ao recém-criado Laboratório de Microbiome in Health and Disease coordenado por Ana Santos Almeida, parte do GIMM-CARE.

GIMM-CARE é o mais recente ramo clínico e translacional do GIMM – o Instituto Gulbenkian de Ciência Molecular em Lisboa, Portugal. O CARE tem como objetivo transformar profundamente a forma como a investigação clínica e translacional é conceptualizada e implementada, para oferecer soluções eficazes às necessidades de saúde mais prementes. Pioneiro em Portugal, o CARE está a construir um modelo de investigação e inovação orientado por missões, centrado nas pessoas e impulsionado por dados, com base no envolvimento de todos os setores e partes interessadas – incluindo cidadãos, pacientes, profissionais de saúde, investigadores, empresários, indústria, autoridades de saúde e governo – em colaborações interdisciplinares e intersetoriais para resolver desafios de saúde.

Legislação aplicável

  • Decreto n.º 57/2016, de 29 de agosto, alterado pela Lei nº 57/2017, de 19 de julho, que aprova um regime de contratação de doutorados destinado a estimular o emprego científico e tecnológico em todas as áreas do conhecimento (RJEC).
    • Código do trabalho, aprovado Lei n.º 7/2009, de 12 de Fevereiro, na sua redação atual.
    • Decreto Regulamentar nº 11-A/2017, de 29 de dezembro. 
    • Decreto-Lei n.º 1/2025, de 16 de janeiro.

Plano de Trabalhos a desenvolver: Estamos à procura de um(a) Investigador(a) doutorado(a) (Computational / Data Scientist) altamente motivado para se juntar à nossa equipa recém criada e liderar um estudo longitudinal em grande escala com o objetivo de identificar e validar biomarcadores do microbioma humano fecal para avaliação de risco e diagnóstico precoce do cancro colorretal (CCR). Como parte deste projeto, o(a) investigador(a) seleccionado(a) será responsável pelo desenvolvimento de uma plataforma de inteligência artificial (IA) baseada no microbioma fecal para prever o risco de CCR na população saudável e a resposta à terapia contra o CCR em pacientes. Este projecto envolverá a integração de dados do microbioma com informações clínicas, nutricionais e de estilo de vida. Por isso, o(a) investigador(a) selecionado(a) deverá ter experiência com pipelines de análise do microbioma, bem como integração de dados clínicos, fatores de estilo de vida e biomarcadores genómicos sanguíneos, em particular com big data e statistical modelling. Além das responsabilidades técnicas, espera-se que o(a) investigador(a) selecionado(a) contribua ativamente para o ambiente intelectual do laboratório e do instituto. Isso inclui preparar e apresentar o progresso científico em seminários, conferências e publicações em revistas reconhecidas.

Composição do júri: Em conformidade com os artigos 28.º n.º 5 do REC e 13.º do Decreto-lei n.º 57/2016, de 29 de agosto, alterado pela Lei n.º 57/2017, de 19 de julho, o júri do concurso é composto pelos Doutores Ana Santos Almeida (Presidente do Júri), Luís Graça e Nuno Morais.

Data de Início do contrato e Local de Trabalho: O presente contrato tem início previsto em junho 2025 mantém-se apenas pelo período necessário à execução do plano de trabalhos proposto; as atividades serão desenvolvidas nas instalações do GIMM em Lisboa/Oeiras e/ou noutros locais necessários à execução do plano de trabalhos.

Remuneração Mensal: A remuneração base ilíquida mensal a atribuir é de 2.622,59€ de acordo com a alínea a) do n.º 1 do artigo 15.º da Lei nº 57/2017, de 19 de julho e com a primeira posição remuneratória do nível inicial previsto no artigo 2.º do Decreto Regulamentar n. 11-A/2017, de 29 de dezembro, correspondente ao nível 38 da tabela remuneratória única, aprovada pela Portaria n.º 1553-C/2008, 31 de dezembro, atualizada pelo Decreto-Lei n.º 1/2025, de 16 de janeiro.

Perfil do(a) candidato(a): São elegíveis a concurso cidadãos nacionais, estrangeiros e apátridas que possuam os seguintes requisitos:

  1. PhD em bioinformática, biologia computacional, microbiologia, ou disciplinas relacionadas;
  2. Experiência significativa na análise e interpretação de dados “omics”, incluindo metagenómica e metabolómica, em ambiente académico ou em empresa;
  3. Experiência comprovada em processamento e análise de dados em larga escala ou dados clínicos;
  4. Conhecimento do microbioma humano e da genética/genómica bacteriana preferencial;
  5. Experiência com machine learning, assim como experiência com workflow managers, como Snakemake;
  6. Experiência significativa com R, Python, SQL e Unix;
  7. Capacidade demonstrada de prosperar em ambiente dinâmico e interdisciplinar;
  8. Forte capacidade de escrita e comunicação oral em inglês;
  9. Publicações em peer-reviewed journals.

Preferencial:

  1. Experiência em start-up, biotech ou pharma;
  2. Capacidade de trabalhar num ambiente multidisciplinar e dinâmico;
  3. Mentalidade flexível focada em soluções;
  4. Visão de futuro, atitude pró-ativa e assertiva;
  5. Capacidade de trabalhar de forma independente e colaborativa.

Processo de candidatura: O concurso tem início em 2 de abril e término em 16 de maio de 2025 (30 dias úteis), devendo a formalização das candidaturas fazer-se através da submissão dos documentos abaixo listados, em formato PDF, para a equipa de People & Culture do GIMM, através do email positions@gimm.pt, identificando a referência da posição no “Assunto”:

  1. Carta de motivação do(a) candidato(a) em língua inglesa;
  2. Curriculum Vitae completo;
  3. Certificado de Doutoramento;
  4. Contacto de 2 referências.

Nota: São excluídos da admissão ao concurso os candidatos que formalizem incorretamente a sua candidatura ou que não comprovem os requisitos exigidos no presente concurso nos prazos aqui indicados. Assiste ao júri a faculdade de exigir a qualquer candidato, em caso de dúvida, a apresentação de documentos comprovativos das suas declarações.

Política de não discriminação e de igualdade de acesso: O GIMM compromete-se a assegurar o cumprimento dos princípios de não discriminação e igualdade e, nessa medida, enuncia que nenhum candidato pode ser privilegiado, beneficiado, prejudicado ou privado de qualquer direito ou isento de qualquer dever em razão, nomeadamente, de ascendência, idade, sexo, orientação sexual, estado civil, situação familiar, situação económica, instrução, origem ou condição social, património genético, capacidade de trabalho reduzida, deficiência, doença crónica, nacionalidade, origem étnica ou raça, território de origem, língua, religião, convicções políticas ou ideológicas e filiação sindical.

Ambiente e experiência internacional:A diversidade é um aspeto fundamental da essência do GIMM, onde trabalham investigadores e pessoal não investigador, de diferentes nacionalidades, backgrounds e áreas de estudo, que promovem a troca de experiências e interações, contribuindo para o desenvolvimento pessoal e profissional de cada pessoa e para a existência de um ambiente internacional, inclusivo e estimulante.

Nos termos do D.L. nº 29/2001, de 3 de fevereiro, o(a) candidato(a) com deficiência tem preferência em igualdade de classificação, a qual prevalece sobre qualquer outra preferência legal. Os candidatos devem declarar na candidatura, sob compromisso de honra, o respetivo grau de incapacidade, o tipo de deficiência e os meios de comunicação/expressão a utilizar no processo de seleção, nos termos do diploma supramencionado.  

Critérios de Avaliação: As candidaturas admitidas a concurso serão avaliadas tendo em conta a qualidade, atualidade e relevância do percurso científico (produção científica e experiência de investigação) e curricular de cada candidato(a) e respetiva adequação ao plano de trabalhos proposto.

  • Primeira fase: Análise do Currículo (60%) e da Carta de Motivação (30%) – Com base no Currículo, será analisado qualitativamente, e no que respeita ao seu conteúdo e relevância para as funções a desempenhar nomeadamente: qualidade dos trabalhos realizados e/ou publicados em áreas afins ao plano de trabalho (30%); experiência e conhecimentos relevantes na área do plano de trabalhos proposto como descrito no perfil do candidato (30%). Com base na carta de motivação será aferida a motivação e o alinhamento com as atividades a executar (30%).
  • Segunda fase: O júri selecionará para entrevista (avaliação: 10%) os 3 candidatos que tenham obtido na primeira fase a classificação mais alta, com um mínimo de 80%. Em caso de empate a decisão de desempate caberá ao presidente do júri.
  1. Após conclusão da aplicação dos critérios de seleção, o júri procede à redação de uma ata, na qual constará todo o processo de recrutamento, avaliação e seleção, na qual se inclui a lista dos candidatos aprovados, por ordem alfabética, com a respetiva classificação.
  2. A decisão final do júri é homologada pelo dirigente máximo da instituição, a quem compete também decidir da contratação.

Resultados: A lista de candidatos admitidos e excluídos bem como a lista de classificação final serão comunicadas via email a todos os candidatos admitidos.

Audiência Prévia e prazo para a Decisão Final: Após notificação, os candidatos têm 10 dias úteis para se pronunciar. No prazo de 90 dias, contados a partir da data limite para a apresentação das candidaturas, são proferidas as decisões finais do júri.

O presente concurso destina-se, exclusivamente, ao preenchimento da vaga indicada, podendo ser feito cessar até à homologação da lista de ordenação final dos candidatos e caducando com a respetiva ocupação da posição em oferta.

Download da oferta de emprego